Kabupaten Klungkung memiliki 3 rumah sakit masing-masing 1 rumah sakit pemerintah dan 2 rumah sakit swasta :

1. RSUD Klungkung : merupakan rumah sakit kelas C. Berlokasi di Jalan Flamboyan, Semarapura.  Memiliki 13 orang dokter spesialis, 15 dokter umum dan 2 orang dokter gigi.

2. RS Bintang : merupakan rumah sakit swasta yang berlokasi di Jln. Ngurah Rai, Semarapura. Memiliki 2 orang dokter spesialis dan 5 orang dokter umum

3. RSAI Permata Hati : merupakan rumah sakit swasta kelas C yang berlokasi di Jalan Kecubung, Semarapura. Memiliki 3 orang dokter spesialis dan 2 dokter umum